Dan jabatan yang pernah beliau emban adalah:
1. anggota Satgas presiden untuk Penanganan WNI di Luar Negeri yang Terancam Hukuman Mati (wilayah Arab Saudi & Malaysia) 2011-2012.
2. Sekretaris Rahima (NGO) 2011-2018.
3. Ketua LPBHNU (Lembaga Pendampingan dan Bantuan Hukum NU) 2010-2015.
4. Wakil Sekretaris Forum Nasional Pesantren 2005-2010.
5. Ketua JP3M (Jam’iyyah Perempuan Pengasuh Pesantren & Mubalighah) Jepara sejak tahun 2018.
6. Koordinator Divisi Advokasi dan Hukum Gerakan Ayo Mondok RMI PBNU sejak 2017.
Sejak 2010, Nyai Hindun Anisah telah menjadi Koordinator APPA (Aliansi Pemberdayaan Perempuan dan Perlindungan Anak).
Baca Juga: Dahsyatnya Rahasia Fatihah Menurut Gus Baha, Membentengi Diri dari Godaan Syetan dan Iblis
Dalam susunan redaksi Majalah Swara Rahima, Nyai Hindun juga menjadi salah satu pengasuh rubrik Tanya Jawab yang terbit setiap enam bulan sekali.