Gus Mus secara terang-terangan menyebut Kiai Husein Ilyas sebagai seorang habib.
Karomah Kiai Ilyas Mojokerto diketahui publik setelah peristiwa yang dialami Kiai Husein Ilyas yang menggetarkan dan mengagumkan.
Kiai Husein Ilyas menuturkan, suatu ketika beliau didatangi oleh dua orang Habib yang datang dari Arab. Kedua Habib ini mengaku merupakan putra dari Habib Abdullah.
Keduanya pun menyampaikan salam dari Habib Abdullah untuk Kiai Husein Ilyas. Namun Kiai Husein tidak pernah mengenal siapa sosok dari Habib Abdullah ini.
Dua Habib ini menyampaikan pesan dari ayahnya yaitu untuk berguru kepada putra dari Kiai Ilyas Mojokerto.
Hal ini tentu membuat Kyai Husein Ilyas menjadi bimbang untuk menerima atau menolak keturunan Rasulullah ini.
Setelah 3 tahun berguru, salah seorang Habib tersebut bercerita bahwa Kiai Ilyas sering menemui ayahnya yaitu Habib Abdullah tanpa pandang waktu.
Biasanya Kiai Ilyas Mojokerto mengajak Habib Abdullah ke Makkah dan Madinah.