Beliau mempunyai jasa yang tak terlupakan dalam sejarah Islam, atas izin Allah dan karenanya selamatlah Sayyidah Fatimah Assughro binti Imam Husein dari penawanan dan penangkapan kala itu.
Juga karenanya, Sayyidina Ali al Asghor (Imam Ali Zainal Abidin) akhirnya terselamatkan dari pembunuhan yang terjadi.
Begitulah para Ahlul Bait Rasulullah Saw. Yang setiap dari mereka mengalir darah titisan dari sang kakek yaitu Rasulullah saw. Mewariskan akhlak, ilmu dan jiwa pemberani dari sang kakek.
Sayyidah Zainab wafat di waktu sore, hari ahad tanggal 15 Rajab tahun 62 Hijriyah.
Dan beliau berwasiat agar dimakamkan di kamarnya yaitu di Masjid Sayyidah Zainab Sekarang.
Setelah kurang lebih sebelas bulan lamanya beliau menyebarkan ilmu, kebaikan dan keberkahan kepada Mesir dan masyarakatnya.
Doa beliau yang sangat terkenal khusus untuk Mesir dan masyarakatnya :
"يا أهل مصر، نصرتمونا نصركم الله، وآويتمونا آواكم الله، وآعنتمونا أعانكم الله وجعل لكم من كل مصيبة فرجا، ومن كل ضيق مخرجا".
"Wahai pendukung Mesir, kalian telah menolong kami (ahlul bait) maka Allah akan menolong kalian.