Ayahnya yang bekerja sebagai buruh penggosok batu intan tidak memiliki pendapatan yang cukup untuk memenuhi kebutuhan ekonomi keluarganya. Meski hidup prihatin dan sederhana, Zaini muda mendapat pendidikan yang baik dari ayahnya dan neneknya yang bernama Salabiah.
Di lingkungan keluarga ia mendapat didikan yang ketat dan disiplin serta mendapat pengawasan dari pamannya, Syekh Semman Mulya.
Pada usia 5 tahun ia belajar al-Qur`an dengan Guru Hasan Pesayangan dan pada usia 6 tahun menempuh pendidikan di Madrasah Kampung Keraton. Pada usia 7 tahun ia masuk ke Madrasah Diniyyah Pondok Pesantren Darussalam Martapura.
Baca Juga: Kisah Nyata, Abah Guru Sekumpul Teriaki Langit! Seketika Hujan Lari Terbirit-birit
Silsilah Sambung Hingga Rasulullah Saw
Sebagaimana dikutip BeritaBantul.com dari buku 'Abah Guru Sekumpul: Intan Permata dari Martapura' karya Luthfi Maulana yang terbit 2021 (cetakan ke-21), Global Pres, dijelaskan bahwa silsilah nasab Abah Guru Sekumpul sampai kepada Rasulullah.
Dijelaskan, pemlik nama KH. Muhammad Zaini merupakan putra KH. Abdul Ghani, termasuk zurriyatul Rasul yang jalur nasabnya melalui Syekh Arsyad Al Banjari, ulama besar Kalimantan.
Berikut silsilah nasab KH. Muhammad Zaini Abdul Ghani sampai kepada Rasulullah.
1. KH. Muhammad Zaini
2. Bin KH. Abdul Ghani