Berbeda dengan masjid biasa, Masjid Khan menyeiakan tempat penginapan yang cukup representatif bagi pelajar yang atang dari berbagai kota.
Tahap ini mencapai perkembangan yang sangat pesat pada abad ke-10 M. Setelah dua tahap perkembangan di atas barulah muncul madrasah.
Pendirian madrasah ini telah memperkaya khazanah lembaga pendidikan di lingkungan masyarakat Islam.
Karena pada masa sebelumnya di lingkungan masyarakat Islam, karena pada masa sebelumnya masyarakat Islam hanya mengenal pendidikan tradisonal yang diselenggarakan di masjid-masjid atau dar-al kuttab.
Sementara itu, dalam buku sejarah pendidikan Islam di Indonesia tidak pernah menginformasikan adanya lembaga pendidikan yang disebut madrasah pada masa-masa awal penyebaran dan perkembangan Islam di Nusantara.
Karena itu, dilihat dari prespektif ini eksitensi madrasah dalam tradisi pendidikan Islam di Indonesia dianggap dan disebut sebagai fenomena modern.
Baca Juga: Tampil Baru dengan Aura Berwibawa, Amalkan Ijazah Doa Ustadz Ujang Busthomi
Dalam perkembangannya, setidaknya ada beberapa faktor yang melatar belakangi lahirnya madrasah di Indonesia, yaitu:
1. Sebagai manifestasi dan realisasi pembaharuan sistem pendidikan Islam.